حسینعلی دیلم، دبیر ستاد مدارس مسجدمحور معتقد است که مدارس مسجدمحور جایی است که همه افراد با انواع نگرش‌ها حضور دارند و اینکه گفته می‌شود فضای ایزوله است، تصور اشتباهی است؛ حجت‌الاسلام علیرضا صادق‌زاده، مدرس دانشگاه تربیت معلم، موفقیت‌های مدارس مسجدمحور را صرفاً تجربیات شخصی دانست که ساختار، قاعده، نظام و چهارچوب مشخصی ندارند.