سیامک بصیری اظهار داشت: کار مرمت این اثر تاریخی با اعتباری بالغ بر یک‌میلیارد ریال در بافت تاریخی شهر شیراز اجرا می‌شود.
وی گفت: ایوان جنوبی مسجد، کف‌فرش‌ها و جداره‌های دیوارها در این عملیات مرمت می‌شود.
بصیری با اشاره به وجود آثار متعدد از دوره زندیه در شهر شیراز خاطرنشان کرد: مسجد آقاباباخان با توجه به نوع معماری و تزئینات بیرونی که تلفیقی از آجر و کاشی با طرح‌های هندسی و گره‌چینی است و همچنین بر مبنای شواهدی که در متون قدیمی عنوان شده، مربوط به دوره زندیه است و المان‌های کاشی‌کاری، تزئینات آجری و شبستان‌های زمستانه و تابستانه در این بنا، سازه‌ای جالب توجه ساخته است.
این بنا در محله قدیمی اسحاق بیگ شیراز واقع شده که در گذشته از بازارچه فیل و مسجد مولا راه داشت و محراب آن با کاشی‌کاری هفت‌رنگ از آثار دوره قاجاریه است.
مسجد آقاباباخان سال ۱۳۷۹ با شماره ۳۴۲۳ در فهرست آثار ملی به ثبت رسید.